Le CNRST est administré par un Conseil d'Administration composés de quinze (15) membres répartis comme suit :
le Délégué Général du CNRST ;
le Recteur de l'Université de Ouagadougou ;
cinq (5) représentants de l'Etat ;
deux (2) représentants des travailleurs dont :
deux (2) personnalités scientifiques indépendantes, du secteur privé et des organisations non
gouvernementales (ONG) évoluant dans le secteur de la production ou la valoristion des produits de la recherche ;
deux (2) représentants de la Chambre de Commerce, d'Industrie et d'Artisanat du Burkina Faso (CCIA.B).
Participent au Conseil d'Administration avec voix consultative:
le Président du Conseil Scientifique et Technique (CST) ;
toute personnalité dont la présence est jugée utile, sur invitation du Président du Conseil d'Administration.
Le Conseil d'Administration élit parmi les administrateurs représentant la tutelle technique un président pour une durée de trois ans renouvelables une seule fois.
Les membres du Conseil d'Administration représentant l'Etat sont nommés par décret pris en Conseil des Ministres sur proposition du Ministre chargé de la recherche scientifique.
Les représentants des travailleurs et de la Chambre de Commerce sont choisis selon des modalités propres à leurs structures spécifiques, proposés par celles-ci et nommés par décret pris en Conseil des Ministres.
Les personnalités scientifiques indépendantes et des utilisateurs des résultats de la recherche sont proposé par le Ministre chargé de la recherche scientifique et nommés par décret en conseil des Ministres.
La durée du mandat de membre du Conseil d'Administration est de trois (3) ans renouvelables une seule fois.
Le Conseil d'Administration assure la responsabilité générale de l'administration du CNRST, délibère sur toutes questions d'importance touchant le fonctionnement et la gestion du CNRST. Le Conseil d'Administration :
examine et approuve les comptes prévisionnels de recette et de dépenses, les conditions d'émission des emprunts, les comptes financiers ; il approuve le projet de budget ;
prend ou donne à bail tous biens et immeubles ;
fait toutes délégations, tous transferts de créances ;
consent toutes subrogations, avec ou sans garantie ;
transfère ou aliène toutes rentes ou valeurs ; il consent tous gages, nantissement, hypothèques ou autres garanties ;
fixe les conditions d'emploi du personnel contractuel de l'établissement ;
se pronoce sur la gestion du Délégué Général.
Le Conseil d'Administration se réunit deux (2) fois par an en session ordinaire et exceptionnellement en session extraordinaire sur convocation de son Président ou à la demande de la moitié de ses membres chaque fois que l'intérêt du CNRST l'exige.
Le lieu, la date et l'heure ainsi que l'ordre du jour des séances sont portés au mois quinze (15) jours à l'avance à la connaissace des membres du Conseil d'Administration ainsi que du contrôleur financier.
Le secrétariat du Conseil d'Administration est assuré par la Délégation Générale. Le Délégué Général est le secrétaire de séance du Conseil d'Administrtion.
La session budgétaire du Conseil d'Administration est convoquée un mois avant le début de chaque exercice ou deux mois au plus après la notification à l'établissement de la subvention de l'Etat.
En cas de retard dans l'adoption du budget, il ne peut être débloqué que 80 % des crédits disponibles de l'exercice précédent.
Le Conseil d'Administration ne peut délibérer valablement que lorsque la moitié au moins des membres assistent à la réunion. Toutefois, si une séance est ajournée faute de quorum, toutes les délibérations prises à la séance suivante à huit (8) jours d'intervalle, sont valables quelque soit le nombre des membres présents, à condition que la deuxième séance ait été convoquée sur le même ordre du jour.
Les délibérations du Conseil d'Administration sont prises à la majorité simple des voix des membres présents ; celle du Président est prépondérante en cas de partage égal des voix.
Les délibérations sont constatées par un procès-verbal dressé par le secrétaire de séance et authentifié par la signature du Président ; une ampliation du procès-verbal authentifié est transmise dans un délai maximum d'un mois au Ministre chargé de la recherche scientifique, au Ministre chargé des finances et aux membres du Conseil d'Administration.